หลังจากเหตุการณ์ไข้หวัดลิง (Simian Flu) ที่เกิดขึ้นจากการทดลองยา เอแอลแซด-112 เมื่อ15ปีก่อนได้สร้างจุดเปลี่ยนให้กับเผ่าพันธุ์มนุษย์ โดยมันได้ทำให้มนุษยชาติได้เกือบสูญพันธุ์ และเหล่าวานรได้เป็นผู้ปกครองผืนดินส่วนใหญ่ ในตอนนี้ลิงได้พัฒนาอารยธรรมตนเองขึ้นมาอย่างรุ่งเรือง แต่แล้ววันหนึ่งเหล่ามนุษย์กลุ่มหนึ่งซึ่งรอดชีวิต ได้ค้นพบอารยธรรมของเหล่าวานร โดยสองเผ่าพันธุ์ได้พยายามอยู่ร่วมกัน แต่ก็มีจุดแตกหักเมื่อ โคบา (โทบี้ เค็บเบล) วานรตัวหนึ่งที่มีความแค้นกับมนุษย์ มีความต้องการจะต่อสู้ ซึ่งผิดกับ ซีซาร์ (แอนดี้ เซอร์คิส) ลิงชิมแพนซีตัวเดิม ซึ่งรักในความสงบและสันติ เกิดขัดแย้งกันและเปิดฉากต่อสู้ กลุ่มมนุษย์ที่อยู่ในนั้นจึงติดอยู่ในวงล้อมและพยายามส่งสัญญาณออกไปเพื่อเรียกหาความช่วยเหลือ โดยผู้รับสัญญาณนั้นไปส่งไปถึงฐานทัพลูอิส แม็คคอร์ด เรื่องราวการต่อสู้ของวานรจะเป็นอย่างไร กลุ่มมนุษย์จะรอดพ้นจากหายนะหรือไม่ มาลุ้นกันต่อได้ใน มหาสงครามพิภพวานร War for the Planet of the Apes ตำนานไตรภาคของพิภพวานร